يعد القلم (S pen) أحد أهم خصائص جوال سامسونج جلاكسي نوت، وقد أضافت له الشركة الكورية الجنوبية ميزات جديدة في نسخة نوت9.

ومن أبرز خصائص S Pen "البلوتوث" الذي يتيح التحكم في الجوال عن بعد من مسافة تسعة أمتار تقريبا وكذلك فتح الكاميرا.

وقد نشر موقع Digital Trends مجموعة من التطبيقات المفيدة في استخدام القلم الالكتروني منها "ون نوت" للملاحظات و"ساين إيزي" للتوقيعات.

سكويد Squid: تطبيق لتدوين الملحوظات بخط اليد، ووصفه الموقع بأنه أحد أفضل البرامج في تجربة الكتابة بالقلم، ويتيح تدوين الملحوظات على ملفات "بي.دي.إف" (PDF) والرسم على الصور وغيرها.

ون نوت OneNote: تطبيق آخر لتدوين الملحوظات يتيح حفظها على خوادم سحابية والرجوع إليها من أي جهاز عليه التطبيق.

انكريدبل Inkredible : انكريدبل يقدم تجربة قريبة من دروس الخطوط في المدرسة، فهو يتيح قلم أشبه بقلم الحبر السائل وكذلك أوراق "مسطرة".

جوجل Handwriting Input: عند استخدام تطبيق للتراسل الفوري يتيح Google Handwriting Input للمستخدم الكتابة بالقلم على الشاشة بدلا من استخدام لوحة المفاتيح.

تطبيق S Pen Keeper: قلم جلاكسي نوت جزء مهم من الجوال، وقد يستخرجه المستخدم وينساه في مكان ما، وكل ما يقوم به هذا التطبيق هو متابعة القلم وإخطار المستخدم بمكانه إذا نساه.

ساين إيزي Sign Easy: تطبيق متخصص في حفظ توقيع المستخدم، ويمكنه من وضع التوقيع على أي وثيقة.

هذه التطبيقات تساعد في الاستخدام الأمثل لقلم جلاكسي نوت 9